精密化の終了

　“X-AUTOFIT X-Build”パレットから修正したモデルを構造ファイル(pdfもしくはmsf)として保存する。

pdbファイルとして保存
　QUANTAによる修正が終了し、CNXやCCP4など、別のソフトウェアを用いて精密化を行う場合は、pdbファイルとして保存する。

1. “X-AUTOFIT X-BUILD”パレット“Save built atoms to PDB”をクリック。
   ⇒“Create PDB file”が表示される。
   
2. 適切な(任意の)ファイル名を入力し、“Save”。
   ⇒分子モデルがpdbファイルとして保存。
   

msfファイルとして保存
　QUANTAによる修正を引き続き行う場合、または、CNX interfaceによる精密化を行う場合は、msfファイルとして保存する。

1. “X-AUTOFIT X-BUILD”パレット“Save built atoms to MSF”をクリック。
   ⇒“Choose the MSF Saving Option”が表示(図2.5.1)。
   
2. “Saving Options are”で適当なオプションを選択し“OK”。
   ＊“Create New Generation of …”が良い？(参考：msfファイルの“Saving Option”)。
   ⇒精密化結果がmsfファイルに保存。

　なお、 “X-AUTOFIT X-BUILD”パレットで“Finish”(X-Buildの終了)しても、精密化結果はmsfファイルとして保存される。
　その場合も“Choose the MSF Saving Option”が表示されるので、上の手順に従って保存すれば良い。

　精密化の過程で、余計な修正を加えてしまうことは良くある。
　“Create New Generation of …”オプションによる保存では、以前の修正内容に基づくファイル(….msf, 00N)も同時に作製される。 不具合が生じ、以前の修正内容に戻りたい場合は、それらナンバリングされたファイルを用いればよい。
＊ファイル名を編集し、拡張子をmsfに戻せば読み込み可能(例えば“demo.msf, 003”を“demo.msf”とする)。

　“Save to New Filename”でも結果は同じだが、一々｢別名｣で保存する手間を考えると、“Create New Generation of …”オプションが便利と思われる。